Lue keskustelun säännöt.
Miksei palstalla saa keskustella makromolekyylien matriisiavusteisesta laserdesorptio-ionisaatiosta?
15.03.2019 |
Tein aiemmin päivällä aloituksen aiheesta, mutta se poistettiin. Olisin vain kysynyt, sattuuko joku tietämään kuinka suuria proteiineja otsikossa mainitulla menetelmällä on mahdollista ionisoida niin, että ne eivät fragmentoidu ja että niistä merkittävä osa on esim. lentoaika-analysaattorilla havaittavissa intakteina molekyyli-ioneina.
Onko aihe todella niin sopimaton, että ketju piti poistaa?
Kommentit (5)
Varsinkin anaalissa tapahtunut optio on vieläkin tabu.
Sisältö jatkuu mainoksen alla
Sisältö jatkuu mainoksen alla
Vierailija kirjoitti:
Kerro lisää, kuulostaa mielenkiintoiselta, näin lasertekniikkaan hieman perehtyneenä.
Mitä haluat kuulla? Matriisiavusteinen laserdesorptioionisaatio (lyh. MALDI) on massaspektrometriassa käytetty näytteiden ionisaatiomenetelmä, joka ei hajota tutkittavia molekyylejä osiin (ainakaan niin reilussa määrin kuin muut ionisaatiomenetelmät). Siksi se soveltuu erityisen hyvin juuri isoille molekyyleille.
Käsittääkseni haittapuolena on tehottomuus, ts. se että vain melko pieni osa näytteestä ionisoituu, ja tämä piirre korostuu sitä enemmän, mitä isokokoisempia molekyylejä yritetään ionisoida.
Olisin ollut kiinnostunut tietämään, missä suurinpiirtein sijaitsee menetelmän käyttökelpoinen yläraja molekyylipainon suhteen, eli miten suuret proteiinit vielä ionisoituvat (fragmentoitumatta) riittävän runsaissa määrin.
Onko olemassa joku päivystävä dosentti, jonka sähköpostiin voin kysymykseni lähettää?
Terve,
Törmäsin tähän ketjuun googletellessa, ja ajattelin ohimennen kommentoida sen verran, että vastaus aloitusviestissä esitettyyn kysymykseen on noin 500 kilodaltonia. Ks. esim. https://www.biocompare.com/188387-2016-Mass-Spectrometry-Buyer-s-Guide/ , kohta "Types of ionization" ja "Laser Desorption".
En tosin tiedä, pystyykö ylipäätään mikään ionisaatiomenetelmä tuottamaan noin isoista molekyyleistä vain yhden alkeisvarauksen omaavia molekyyli-ioneja, eli 500 000:n luokkaa oleviin massa-varaussuhteisiin tuskin käytännössä päästään.
(Tämä siis siltä varalta, että joku toinenkin ketjun googlella löytää, ja on kiinnostunut tietämään vastauksen.)
Kerro lisää, kuulostaa mielenkiintoiselta, näin lasertekniikkaan hieman perehtyneenä.